Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPN1LA6NDY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPN1LA6NDY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms