Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM49BA6NDI0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms