Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSDA5PKW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSDA5PKW4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSDA5PKW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms