Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEFA5A3E0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEFA5A3E0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms