Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP5LA4QPB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 536.4 ms