Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRD1A4D1F6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRD1A4D1F6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms