Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA8A3KMH1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA8A3KMH1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms