Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC162PA2VCL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms