Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC144AA2RUR9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC144AA2RUR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms