Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMX2A2RU54 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms