Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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