Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC26A0AVF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TTC26A0AVF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms