Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV5S2A0A599 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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