Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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