Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0J9YYE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0J9YYE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0J9YYE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms