Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J269 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0B4J269 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0B4J269 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms