Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-27A0A075B6S5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-27A0A075B6S5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms