Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLH3Q9UHC1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms