Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRBP1Q9P2E9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms