Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TBCCD1Q9NVR7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms