Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO1B3Q9NPD5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms