Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms