Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRXQ9BXM0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRXQ9BXM0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms