Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms