Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC94Q9BW85 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms