Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms