Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms