Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USB1Q9BQ65 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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