Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms