Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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