Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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