Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BORCS6Q96GS4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms