Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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