Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms