Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL2Q8NHH9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms