Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf47Q8NEP4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf47Q8NEP4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms