Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms