Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms