Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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