Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms