Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWISTNBQ3B726 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms