Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms