Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT16Q17RD7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms