Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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