Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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