Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms