Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms