Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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