Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms