Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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