Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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